Обзор проектов и программ
Основным направлением  деятельности МФСА явилось  информирование катастрофическом   положении Аральского моря и организация финансирования социально  экономических, водохозяйственных  и экологических  программ в регионе.
ПБАМ-1:
В состав программы вошло восемь компонентов на базе концепций проектов. По результатам ПБАМ подготовлен итоговый документ «Progress Report»,  который разослан  международным организациям и странам донорам. На вся программу со стороны международных организаций  был выделен грант 47,7млн. $  US и 278млн.$ US различных займов.
Реализованы следующие проекты:

• Региональная  стратегия управления

             водными ресурсами;

• Обеспечение устойчивости платин и водохранилищ;

• Гидрометеорологические службы;

• Региональная система экологической информации;

• Управлением качеством вод;

• Восстановление  водно-болотных угодий;

• Восстановление северной части Аральского моря;

• Экологические исследования в бассейне Аральского моря;

• Проект по регулированию стока реки Сырдарья и развитию дельты;

• Чистая вода, санитария, здоровье-Узбекистан;

• Чистая вода, санитария, здоровье-Туркменистан;

•   Чистая вода, санитария, здоровье-Казахстан;

•   Чистая вода, санитария Таджикистана;

• Среднесрочное  водоснабжение;

• Комплексный проект управление водными и земельными ресурсами на территории верхнего  водосброса;

• Оперативное управление водными  ресурсами;

• Развитие потенциала;

• Проект по управлению водными ресурсами и окружающей средой (УВРОС).

Программа SPECA:
В соответствии  с Ташкентской декларации  глав Государств ЦА, ЕЭК и ЭСКАТО ООН в 2000-2003гг. разработана Стратегия рационального и эффективного использования  водно- энергетических  ресурсов стран ЦА.
Для поэтапной реализации этой стратегии согласованы следующие направления деятельности:

• Сотрудничество в области безопасности плотин;

• Информационная база данных;

• Оценка экологических последствий в трансграничном контексте;

• Энергоэффективность;

• Вдно-энергетический консорциум;

• Продолжение проектов сотрудничества по трансграничным рекам Чу и Талас (Казахстан-Кыргызстан)  и Вахш-Амударья (Таджикистан-Туркменистан) с внедрениям интегрированного управления водными ресурсами;

• Ветровая энергетика;

• Трансграничный обмен электроэнергией.

ПБАМ-2:
Основные направления ПБАМ-2 (Программа конкретных действий по улучшению экологической и социально-экономической обстановки в бассейне Аральского моря на период 2003-2010гг.) были одобрены на Душанбинском саммите Глав государств  Центральной Азии. ПБАМ-2 была разработана с участием представителей всех стран региона при поддержке Швейцарской миссии по проблемам бассейна Аральского моря, Европейского Союза, ОБСЕ и ЮСАИД. В  последствии она была утверждена решением Правления Фонда 28 августа 2003 года. Программа включает 14 приоритетов и разбита на четыре блока:

• Социально-экономический;

• Водохозяйственный;

• Экологический;

• Мониторинг окружающей среды;

 
Региональный центр Гидрологии:  По инициативе  Исполкома МФСА, решением правления МФСА от 28 августа 2003 года создан Региональный Центр Гидрологии (РЦГ) при Исполкоме МФСА. Это организация является юридическим лицом  со статусом международной организации . положение о РЦГ одобрено руководителями пяти национальных гидрометеорологических служб (НГМС) и утверждено Правлением МФСА 27 марта 2004 г.
На региональном совещании  Руководителей НГМС государств  Центральной Азии, Исполкома МФСА и доноров (22-23 февраля 2004года г. Алматы)  принято решение об организации рабочей группы по оценки состояния гидрометеорологической сети бассейна Аральского моря и определения приоритетных направлений развития НГМС государства ЦА.
Для поддержки данных работ  Швейцарский офис по сотрудничеству и развитию (SDC) разработал «Проект РЦГ».
Прозрачная открытая деятельность Рабочей группы, групп дизайна и планирования , руководителей НГМС позволила в течение нескольких встреч обсудить и принять техническое задание, утвердить график работы и схему отчета , далее одобрить объединенный отчет и определить группу мониторинга и бюджет проекта.
В данное время Филиалы РЦГ действуют в Казахстане, Таджикистане и Узбекистане,  в 2006 году будут созданы в Туркменистане. На эти цели в рамках «Проекта РЦГ» предусмотрено 1,2млн.$.
Национальные гидрометеорологические  службы стран бассейна  Аральского моря  при содействии  Всемирной организации (ВМО) и швейцарской миссии по  Аральскому морю подготовили Проект СНГЦ_АРАЛ (ARAL-HYCOS).
Данный проект направлен на улучшение системы  международными стандартами.
Реализация проекта СНГЦ_АРАЛ позволит существенно повысить оперативность обмена гидрометеорологической  информацией между НГМС региона и экологическими проектами, включенными  в ПБАМ-2, утвержденными Правлением МФСА.